Esant poreikiui imame ortakiuose susidariusius nešvarumų fragmentus, ir siunčiame į specializuotas laboratorijas išauginti pasėlius.
Mikrobiologiniai tyrimai leidžia nustatyti ir identifikuoti esamas rizikas, ir pritaikyti veiksmingiausius būdus kovoti su mikrobiologinio užterštumo aplinka ortakiuose parenkant biocidus.